2026年5月22日に、芦生研究林と武田薬品工業株式会社 京都薬用植物園（以下、京都薬用植物園）は、植物の保全に関する連携協定を締結しました。この協定は、相互に連携協力することにより、芦生希少植物域外保全プロジェクトをはじめ、植物の保全、栽培、展示、教育、研究、社会貢献活動を進めることを目的としています。
芦生研究林では、1990年代後半からニホンジカによる植物の過採食が続いています。多くの植物が食べられ、これまで普通に見られた植物さえも見かけなくなってきています。そこで芦生研究林は、研究者、行政、猟友会、市民ボランティア、企業などと連携し、2006年から防鹿柵による植生保護、2008年からシカの捕獲を実施しています。
特に深刻な状況なのが、もともと個体数が少なく、限られた場所にのみ生育している希少植物のさらなる減少です。そこで、2018年から、京都大学人間・環境学研究科の阪口翔太助教（現・農学研究科・教授）の呼びかけのもと、京都大学と京都府立植物園が連携し、芦生希少植物域外保全プロジェクトが始まりました。研究林内で絶滅に瀕している貴重で希少な植物種の種子や株を遺伝的多様性に配慮し採取し、生育地の外（域外）で、緊急避難的処置として育て保護しています。緊急度が高く、比較的栽培が容易なゼンテイカ、タヌキラン、ヒメシャガ、コバノトンボソウ、タイミンガサ、クルマバハグマ、マルバスミレ、チョウジギク、リュウキンカ、ミヤマキスミレを対象種としています。京都薬用植物園には、2022年からプロジェクトにご協力いただき、タイミンガサ（コアコレクション）、タヌキラン・ゼンテイカ・ヒメシャガ（サブコレクション）を栽培いただいています。
さらに、2025年10月に開園した芦生保全植物園の植物観察エリアの整備においても京都薬用植物園にご協力いただきました。保全・栽培・展示を行う京都薬用植物園が保有するノウハウを活かし、エリア内に生えている植物や地形を活かした観察路の設計・工法・管理から、種名板に至るまで数多くのアドバイスをいただきました。
京都薬用植物園では、アシウスギ・アシウアザミ・アシウテンナンショウ・コマユミなど芦生を特徴づける植物を植栽した芦生エリアを2025年に開設されました。芦生研究林内の特徴的な木本や草本を一つの場所に展示し、来訪園者へ研究林の多様な植生を紹介することを目的としています。植栽されているのは、芦生研究林で種子が採取され上賀茂試験地で栽培されていた植物（コミネカエデ、ハイイヌガヤなど）、芦生希少植物域外保全プロジェクトの域外保全株からの増殖個体（チョウジギク、クルマバハグマ、ヒメシャガ、ゼンテイカ）、芦生研究林より提供した植物（アシウアザミなど）などです。
また、京都薬用植物園では、きょうと生物多様性センター、京都府立植物園、京都大学上賀茂試験地などと連携し、薬用植物及び、京都府レッドリスト掲載種（府内の希少植物）の種子保存事業を展開してきています。芦生研究林の植物についても、野外での絶滅に備え、種子の長期保存を進めていきます。
なお、京都薬用植物園と京都大学フィールド科学教育研究センター上賀茂試験地は、国際種子交換事業をはじめとする植物の栽培や植物資源の栽培・保全にかかわる分野での事業連携をすることにより、国際的な社会貢献活動の展開や生物多様性の保全、植物園機能の充実、専門人材の育成、環境教育の発展などに寄与することを目的に2024年１月に連携協定を締結しました。
■ 本協定の内容
1. 協定の名称：京都大学フィールド科学教育研究センター芦生研究林と武田薬品京都薬用植物園の連携に関する協定書
2. 協定締結日：2026年5月22日（生物多様性の日）
3. 協定締結の目的：芦生希少植物域外保全プロジェクトをはじめ、植物の栽培、植物資源収集・保存などの分野で、両者が相互に連携協力することにより、生物多様性の保全を図り、それぞれの機能の充実、専門人材の育成、環境教育の発展に寄与することを目的とする。
4. 連携事項：主に以下分野について、連携し協働します。
（１）芦生研究林の希少植物種の生息域外保全事業の連携に関する事項
（２）植物の栽培・展示に関する事項
（３）植物資源の収集・保全に関する事項
（４）植物資源を用いた教育・研究・社会貢献活動に関する事項
